7.1. pta

Probabilistic Thermodynamic Analysis of metabolic networks.

7.1.1. Subpackages

• 7.1.1.1. pta.data
  • 7.1.1.1.1.1. pta.data.compartment_parameters
  • 7.1.1.1.1.2. pta.data.concentration_priors
  • 7.1.1.1.1.3. pta.data.models
• 7.1.1.2. pta.gibbs_estimators
  • 7.1.1.2.1.1. pta.gibbs_estimators.equilibrator_gibbs_estimator
  • 7.1.1.2.1.2. pta.gibbs_estimators.gibbs_estimator_interface
• 7.1.1.3. pta.sampling
  • 7.1.1.3.1.1. pta.sampling.commons
  • 7.1.1.3.1.2. pta.sampling.convergence_manager
  • 7.1.1.3.1.3. pta.sampling.primitives
  • 7.1.1.3.1.4. pta.sampling.tfs
  • 7.1.1.3.1.5. pta.sampling.uniform

7.1.2. Submodules

• 7.1.2.1. pta.commons
• 7.1.2.2. pta.compartment_parameters
• 7.1.2.3. pta.concentrations_prior
• 7.1.2.4. pta.constants
• 7.1.2.5. pta.distributions
• 7.1.2.6. pta.flux_space
• 7.1.2.7. pta.metabolite
• 7.1.2.8. pta.metabolite_interpreter
• 7.1.2.9. pta.model_assessment
• 7.1.2.10. pta.pmo
• 7.1.2.11. pta.thermodynamic_space
• 7.1.2.12. pta.utils